環境に配慮し、安全な食糧を生産するため、化学合成農薬は慣行栽培の50％以上使用削減を大部分の作物で実現しています。更に柑橘・水稲を除き、除草剤は使用していません。

自然の生態系を活かすため、土着天敵の活用を進め、天然の植物や魚介類から摘出したエキス（天恵緑汁、天然アミノ酸、海藻緑汁など）を作物や土に施しています。

作物自体の活力と本来の味を引き出すため、センター独自の自家製造によるボカシ肥料（有機発酵肥料）を使った有機肥料主体の栽培を進めています。

作物の健全な生育を促し、栄養価が高く美味しい農産物を育てるため、カルシウムやマグネシウムなどのミネラルを十分に施し育てています。

「健康な作物は健康な土壌から」をモットーに、土づくりと土壌診断を基にした肥培管理に努めています。